Villa Beatrice d’Este trägt den Namen der Seligen Beatrice, die zwischen 1221 und 1226 lebte und ein Mitglied des Hauses Este war. Auf dem Monte Gemola gab es ein antikes Kloster von Eremiten, das die Heilige nach ihrem Umzug von Salarola in ein Monasterium verwandelte. Hier lebte sie bis zu ihrem Tod in religiösem Leben, und ihr Ruf der Heiligkeit verbreitete sich schnell, was zu Spenden und Verehrung führte.
Im XVI. Jahrhundert wurden die Nonnen nach Padua verlegt und die Überreste der Seligen wurden in die Kirche Santa Sofia gebracht. Nach einer Phase der Vernachlässigung ging das Areal 1657 in den Besitz venezianischer Privatpersonen über und wurde in eine Villa umgewandelt, wobei jedoch Spuren des alten Klosters erhalten blieben. Zwischen dem XIX. und XX. Jahrhundert erfuhr das Gebiet Veränderungen, doch die Restaurierungen in den 70er und 80er Jahren haben die ursprüngliche Struktur wiederhergestellt und aufgewertet.
Heute beherbergt Villa Beatrice ein naturkundliches Museum, das den Colli Euganei und deren Umwelt patrimoniun gewidmet ist, mit Abteilungen über die lokale Flora und Fauna. Die neue Ausstellung MUSeuM integriert immersive Technologien und interaktive Rundgänge, um Geschichte, Landschaft und Kultur des Gebiets aufzuwerten, wodurch der Besuch zu einem lehrreichen und eindringlichen Erlebnis wird.
